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토양중에 유해한 유기 오염물질을 토양미생물을 이용하여 독성이 낮거나, 유동성이 낮은 상태로 전환시키는 것이다.
특히 탄화수소를 주성분으로 한 유류토양을 무해한 물질 즉, 비활성 무기 잔류물이나 미생물 증식환경으로 영구히 전환시켜 자연 생태계의 균형을 유지시킴으로써 토양을 복원시키는 것이다.